日本的胃镜检查和国内普遍使用的口腔进入式胃镜不同，由于是从鼻腔进入，内窥镜管直径仅为6mm，对用户的心理压力小很多。

但不论是口腔进入式胃镜，还是鼻腔进入式胃镜，均会有不同程度的不适感，但并非疼痛感，是可以忍受的范围。医生也鼓励用户自己看内窥镜显示器，检查时候听医生讲解情况。